相手の言ったことが間違いないかどうか聞く表現です。sureは「〜に自信をもっている」という意味なので、その後に that ＋ 相手が話していた内容が省略されています。その他のフレーズとしては、Are you certain? / Are you positive? / You sure about that? があげられます。
＜SKIT＞
A：He doesn’t seem to be here.
B：Are you sure? He said he’d be waiting here to meet us at six.
　　A：彼、ここに来ないみたいね。
　　B：確かかい？ 6時に僕らとここで落ち合うって言ってたんだよ。
『英会話お決まり表現160』
（マクミラン・ランゲージハウス　浦島久、クライド・ダブンポート共著）より