deal はここでは「問題」という意味です。何かに仰天している相手に対して「大騒ぎするような事態ではないよ、大丈夫」と安心させるのに便利なフレーズとしてよく使用されています。It’s no big thing. / It’s nothing. も似た意味です。
＜SKIT＞
A：You let him drive my car?
B：It’s no big deal. It was just to the store down the street.
　　A：あなたったら私の車を彼に運転させたんですって。
　　B：たいしたことじゃないよ。通りをちょっと行った先にある店までだから。
『英会話お決まり表現160』
（マクミラン・ランゲージハウス　浦島久、クライド・ダブンポート共著）より